신․구조문대비표 과세사실판단자문 사무처리규정
현 행	개 정
제2조(정의) ① (생략) 1. “과세쟁점사실”이란 국세의 부과, 징수, 환급 등과 관련된 일정한 사실관계를 확정하거나 확정된 사실관계를 해석된 법령에 적용함에 있어서 국세공무원과 납세자 간에 다른 의견이 있거나 있을 소지가 있는 경우(본청·지방국세청 감사 또는 과세자료 통·수보와 관련하여 감사공무원과 피감사공무원 간에 또는 과세자료 통·수보 공무원 간에 다른 의견이 있는 경우를 포함한다) 그 사실관계 전부를 말한다. 2. (생략) 3. “동일쟁점 다수사례”란 과세처분 관련 사실판단사항 등이 동일하거나 유사하면서 다수의 납세자와 다수의 처분청간 다툼이 있거나 예상되어 일관성 있는 과세방침의 정립이 필요하다고 본청 주무국 또는 납세자보호관이 인정한 사례를 말한다. ② (생략)	제2조(정의) ① (현행과 같음) 1. -------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 피감사공무원 간 ----------------- ----------------------------------------------------------------------------. 2. (현행과 같음) 3. -------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------ 있을 소지가 있어 ----------------------------- ------------------------------------------------. ② (생략)
제3조(과세사실판단자문위원회 설치) ① (생략) ② 과세사실판단자문위원회의 심의사항은 다음 각 호의 구분에 따른다. 다만, 과세쟁점사실과 관련된 세액의 합계가 2억원(서울지방국세청·중부지방국세청·부산지방국세청은 4억원) 이상인 경우에는 지방국세청 과세사실판단자문위원회에서, 100억원 이상인 경우에는 본청 과세사실판단자문위원회에서 심의한다. 1. ∼ 3. (생략)	제3조(과세사실판단자문위원회의 설치) ① (현행과 같음) ② ---------------------------------------- ----------------------------, 쟁점별 세액이-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. 1. ∼ 3. (현행과 같음)
제4조(본청 과세사실판단자문위원회의 구성) ① 본청 과세사실판단자문위원회는 위원장과 8명의 위원으로 구성한다. ② 위원장은 납세자보호관으로 하고, 위원은 다음 각 호의 사람으로 하되, 본청 행정심 결정사례가 있었으나 이와 다른 과세방침 결정이 필요하다고 인정되는 경우에 열리는 “동일쟁점 다수사례” 과세사실판단자문위원회는 본청 국장단으로 구성한다. 1. 상임위원 : 심사1담당관(또는 심사2담당관), 법령해석과장, 법무과장 2. 제1호의 위원을 제외한 위원은 소속 과장 중 위원장이 지정하는 4명과 변호사 자격이 있는 팀장 1명 ③ 위원장이 부득이한 사유로 직무를 수행할 수 없거나 공석인 경우에는 심사1담당관이 그 직무를 대행한다. ④ 위원장은 위원회를 구성할 때 납세자보호ㆍ징세법무ㆍ조사ㆍ세원관리 분야의 공무원을 고르게 위원으로 배정하여야 한다. ⑤ (생략)	제4조(본청 과세사실판단자문위원회의 구성) ① ---------------------------------- 6명의 -----------------. ② ---------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------- 경우의 과세사실판단자문위원회는 본청 국장단으로 구성한다. 1. 상임위원 : ---------------------------,법무과장, 법규과장 2. --------------------------------------- 위원장이 지정하는 3명 ③ ---------------------------------------- ------------ 심사1담당관(또는 심사2담당관)-- -----------. ④ ---------------------------------------- ------------------------------ 과장 중에서 ------------------------. ⑤ (현행과 같음)
제5조(지방국세청 과세사실판단자문위원회의 구성) ① 지방국세청 과세사실판단자문위원회는 위원장과 8명의 위원으로 구성한다. ② 위원장은 납세자보호담당관으로 하고, 위원은 다음 각 호의 사람으로 한다. 1. 소속 과장 중 지방국세청장이 지정하는 5명 2. 납세자보호담당관이 각 국·실의 협조를 받아 지정하는 팀장 3명 ③ ∼ ⑤ (생략)	제5조(지방국세청 과세사실판단자문위원회의 구성) ① --------------------------------------- 6명---------------------. ② (좌동) 1. ---------------------------------- 4명 2. -------------------------------------- -------------- 2명 ③ ∼ ⑤ (생략)
제6조(세무서 과세사실판단자문위원회의 구성) ① ∼ ③ (생략) ④ 위원장은 위원회를 구성할 때 조사ㆍ세원관리 분야의 공무원을 고르게 위원으로 배정하여야 한다. ⑤ (생략)	제6조(세무서 과세사실판단자문위원회의 구성) ① ∼ ③ (현행과 같음) ④ <삭제> ⑤ (생략)
제10조(과세사실판단자문신청 대상) ① 국세공무원은 다음 각 호의 업무처리 중 과세쟁점사실이 발생한 경우에는 이에 대하여 과세사실판단자문신청을 할 수 있다. 1. ∼ 2.(생략) 3. 환급 등 현장확인 4.∼ 6.(생략) 7. 중소기업세무컨설팅 협약기업에 대한 사후관리 8. (생략) ② 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 것은 자문신청 대상에서 제외한다. 1. ∼ 4. (생략) 5. 세법령, 기본통칙 및 세법집행기준을 통해 판단이 가능한 경우 6. ∼ 7. (생략)	제10조(신청대상) ① (좌동) 1. ∼ 2.(현행과 같음) 3. 환급업무 4.∼ 6.(현행과 같음) 7. <삭제> 8. (현행과 같음) ② (좌동) 1. ∼ 4. (현행과 같음) 5. 과세 여부 등을 명확히 판단할 수 있는 사안인 경우 6. ∼ 7. (현행과 같음)
제12조(과세사실판단자문의 신청방법) ① 과세사실판단자문신청은 신청인이 소속된 납세자보호담당관에게 하되, 과세쟁점사실과 관련된 세액의 합계가 100억원 이상인 경우에는 소속된 지방청 납세자보호담당관에게 신청한다. 다만, 본청 소속 공무원의 업무처리 자문 및 동일쟁점 다수사례 관련사항은 심사1담당관에게 신청한다. ② ∼ ④ (생략)	제12조(신청방법) ① ---------------------------------------- ----------------------------, 쟁점별 세액이 ------------------------------------------ 지방국세청장(납세자보호담당관)--------. ----,------------------------------------- ----------------- 국세청장(심사2담당관)---- -------. ② ∼ ④ (현행과 같음)
제14조(본청ㆍ지방국세청 이송) ① 세무서장(납세자보호담당관)은 과세쟁점사실과 관련된 세액의 합계가 지방국세청 과세사실판단자문위원회 처리대상인 경우에는 자문제외 여부를 검토하여 과세사실판단자문신청 대상에 해당하는 경우에만 자문신청서와 세액산출근거를 지방국세청장(납세자보호담당관)에게 이송하여야 한다. 다만, 과세쟁점사실과 관련된 세액의 합계가 기준금액 미만인 경우라도 쟁점사항이 다음 각 호에 해당하는 경우에는 세무서장이 해당 자문신청서를 지방국세청장(납세자보호담당관)에게 이송할 수 있다. 1. ∼ 2. (생략) ② 지방국세청장(납세자보호담당관)은 과세쟁점사실과 관련된 세액의 합계가 100억원 이상인 경우에는 자문제외 여부를 검토하여 과세사실판단자문신청 대상에 해당하는 경우에만 자문신청서를 국세청장(심사1담당관)에게 이송하여야 한다. 다만, 과세쟁점사실과 관련된 세액의 합계가 100억원 이상인 경우라도 쟁점사항이 다음 각 호에 해당하는 경우에는 국세청장(심사1담당관)이 해당 자문신청서를 지방국세청장(납세자보호담당관)에게 재이송 할 수 있다. 1. 세법에 따른 부당행위계산 부인 관련 사안 2. ∼ 3. (생략) ③ (생략) ④ 세무서장(납세자보호담당관) 또는 지방국세청장(납세자보호담당관)은 자문신청사항이 제10조제1항제6호의 본청 감사(처분 및 현지시정)와 관련된 경우에는 국세청장(심사1담당관)에게 이송하여야 한다.	제14조(본청ㆍ지방국세청 이송) ① -------------------------- 쟁점별 세액이 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------, 쟁점별 세액이 -------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. 1. ∼ 2. (현행과 같음) ② ------------------------------ 쟁점별 세액이 ----------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------(심사2담당관)에게 이송하여야 한다. ------, 쟁점별 세액이---------------------- ----------------------------------------- ---------------국세청장(심사2담당관)이 --- -------------------------------------------------------------. 1. <삭제> 2. ∼ 3. (현행과 같음) ③ (현행과 같음) ④ ---------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------ -----------------국세청장(심사2담당관)---- -------------.
제15조(요건심의 및 심의 제외) ① 납세자보호담당관(심사1담당관)은 자문신청을 접수한 때에 신청요건을 검토하여 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 때에는 신청내용을 심의하지 아니한다는 결정을 하고, 그 결과를 ｢과세사실판단자문 심의제외 결정 통보서｣(별지 제6-1호 서식)에 의하여 신청인에게 통보한다. 1. ∼ 5. (생략) ② <삭제> ③ 납세자보호담당관은 자문신청사항이 제10조에서 정한 신청대상에 해당하지 않는 사안인지 판단하기 곤란한 경우에는 접수 즉시 과세사실판단자문신청서 사본 1부와 ｢과세사실판단자문신청대상 조회서｣(별지 제11호 서식)를 국세청장(심사1담당관)에게 송부하여 그 의견을 조회할 수 있다. ④ 제3항에 따라 의견조회를 받은 국세청장(심사1담당관)은 3일 이내에 신청대상여부를 결정하여 통보하여야 한다.	제15조(요건심의 및 심의제외) ①---------------(본청 심사2담당관)-------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. 1. ∼ 5. (현행과 같음) ② <삭제> ③ ---------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------(심사2담당관) -------------------------------------. ④ ---------------------------------------- (심사2담당관)----------------------------- ------------------------.
제16조(과세사실판단자문위원회 심의자료의 작성 및 배부) ① 납세자보호담당관(간사, 본청 심사1담당관)은 ｢과세쟁점사실 조사서｣(별지 제2호 서식)를 작성하여 이를 신청인에게 통보하여야 한다. ② 납세자보호담당관(간사, 본청 심사1담당관)은 ｢과세쟁점사실 조사서｣를 ｢과세사실판단자문위원회 회부서｣(별지 제3호 서식)에 첨부하여 위원장에게 보고하고 과세사실판단자문위원회를 개최할 것을 요청하여야 한다. ③ 납세자보호담당관(간사, 본청 심사1담당관)은 회의개최일이 결정된 때에는 이를 회의개최일 3일 전까지 각 위원에게 통지하고 제2항의 ｢과세쟁점사실 조사서｣ 등 심의자료를 배부하여야 한다.	제16조(과세쟁점사실조사서의 작성 및 배부) ① 납세자보호담당관(본청 심사2담당관)은 ｢과세쟁점사실조사서｣(별지 제2호 서식)를 작성하여야 한다. ② ---------------(본청 심사2담당관)------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. ③ ---------------(본청 심사2담당관)------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------- 자료를 ------------.
(신설)	제16조의2(심의자료 사전열람) ① 납세자보호담당관(본청 심사2담당관)은 과세사실판단자문위원회에서 안건을 심의하기 전에 심의자료(과세쟁점사실 조사서의 심의의견 또는 판단을 제외한 부분을 말하며, 이하 이 조에서 “심의자료”라 한다)를 ｢심의자료 사전열람 안내｣(별지 제15호 서식)에 첨부하여 과세사실판단자문위원회 개최일 5일 전까지 신청인과 납세자 및 대리인에게 송부하여야 한다. ② 제1항의 심의자료는 신청인에게는 내부 메일을 이용하여 송부하고, 납세자 또는 그 대리인에게는 국세청 메일 또는 국세청 전자팩스 시스템을 이용하여 송부하여야 한다. ③ 납세자 또는 대리인의 메일이 확인되지 아니할 경우에는 납세자보호담당관(본청 심사2담당관)은 심의자료를 열람할 수 있다는 내용의 안내문을 납세자 또는 대리인에게 팩스로 송부하거나 전화 등으로 안내하여야 한다.
제17조(납세자 의견조회) ① 납세자보호담당관(본청 심사1담당관)은 ｢과세쟁점사실 조사서｣를 작성하기 위하여 필요한 경우 과세사실판단자문신청서 사본 1부를 ｢과세쟁점사실관계에 대한 의견조회서｣(별지 제9호 서식) 및 ｢과세쟁점사실관계에 대한 의견회보서｣(별지 제10호 서식)와 함께 납세자에게 송부하여 납세자 의견을 조회할 수 있다. ② ∼ ③ (생략)	제17조(납세자 의견조회) ① ----------------(본청 심사2담당관)------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. ② ∼ ③ (현행과 같음)
제19조(과세사실판단자문위원회의 운영) ① ∼ ③(생략) ④ 회의는 공개하지 아니한다. 다만, 위원장이 심의를 위하여 필요하다고 인정하는 때에는 신청인, 납세자 또는 관련인을 출석시켜 의견을 들을 수 있다. 이 경우 출석하고자 하는 자는 ｢의견진술신청서｣(별지 제13호 서식)을 작성하여 해당 자문위원회 개최 3일 전까지 납세자보호담당관(본청 심사1담당관)에게 제출하여야 한다. ⑤ 납세자보호담당관(심사1담당관)이 과세사실판단자문위원회 회의를 개최하는 경우에는 회의록을 작성하여야 한다.	제19조(과세사실판단자문위원회의 운영) ① ∼ ③ (현행과 같음) ④ ---------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------(본청 심사2담당관) ----------------. ⑤ --------------(본청 심사2담당관)-------- -------------------------------------------------------------.
제19조의1(본청 과세사실판단자문위원회 사전회의 등) ① 본청 과세사실판단자문위원회에 접수된 안건은 신청서 접수 2주일 이내에 사전회의를 개최하여야 한다. 사전회의에서는 신청인이 출석하여 신청내용을 설명하고, 각 상임위원들은 상임위원별 검토·자문 사항을 토의한다. ② (생략) ③ 법령해석과장, 법무과장은 사전회의 후 1주일 이내에 상임위원 검토결과를 심사1담당관에게 제출하여야 한다. ④ 위원장은 사전회의 후 추가적인 검토가 필요하다고 판단되면, 상임위원들이 참석하는 상임위원회를 개최할 수 있다.	제19조의1(본청 과세사실판단자문위원회 사전회의 등) ① --------------------------------------- 위원장이 필요하다고 인정하는 경우 신청서 접수 2주일 이내에 사전회의를 개최할 수 있다. ---------------------------------------------------------------. ② (현행과 같음) ③ 위원장은 사전회의 후 추가적인 검토가 필요하다고 판단되면, 상임위원들이 참석하는 상임위원회를 개최할 수 있다. ④ 법무과장, 법규과장은 상임위원 검토결과를 심사2담당관에게 제출하여야 한다.
제20조(과세사실판단자문의 결정) ① 과세사실판단자문신청의 자문결정은 다음 각 호의 구분에 따르되, 출석위원 과반수 찬성으로 의결한다. 1. ∼ 3. (생략) 4. 기타 : 자문대상 또는 유사한 사건에 대한 불복청구 또는 소송이 진행 중이거나, 국세행정의 파급효과 등을 고려하여 판단을 유보할 필요가 있는 경우에 내리는 결정 ② <삭제> ③ ∼ ④ (생략)	제20조(과세사실판단자문의 결정) ① (좌동) 1. ∼ 3. (현행과 같음) 4. 기타 : -------------------------------- --------------------- 진행 중인 경우, 국세행정의 파급효과 등을 고려하야 판단을 유보할 필요가 있는 경우 또는 자문대상에 대한 추가 검토가 필요한 경우 등에 내리는 결정 ② <삭제> ③ ∼ ④ (현행과 같음)
제21조(과세사실판단자문의 처리기한) ① (생략) ② 지방국세청 및 국세청 본청 과세사실판단자문위원회는 자문신청일부터 30일 이내에 자문결정을 하여야 한다. ③ ∼ ⑤ (생략)	제21조(과세사실판단자문의 처리기한) ① (현행과 같음) ② 본청 및 지방국세청 --------------------- --------------------------------------------------------. ③ ∼ ⑤ (현행과 같음)
제23조(자문결정의 활용 및 활용결과 통보) ① (생략) ② 신청인이 자문결과를 활용한 경우에는 즉시 그 결과를 납세자보호담당관(국세청 심사1담당관)에게 통보하여야 한다.	제23조(자문결정의 활용 및 활용결과 통보) ① (현행과 같음) ② ---------------------------------------- ------------------------(본청 심사2담당관) ----------------.
(신설)	제23조2(이해충돌방지 의무) 과세사실판단자문업무를 수행하는 세무공무원은 공정한 직무수행을 위해 ｢공직자의 이해충돌 방지법｣, ｢공직자의 이해충돌 방지법 시행령｣ 및 ｢국세청 공직자의 이해충돌 방지제도 운영지침｣을 준수하여야 한다.
제24조(자문내역의 전산관리) 국세청장(심사1담당관), 지방국세청장(납세자보호담당관) 또는 세무서장(납세자보호담당관)은 과세사실판단자문신청서를 접수하거나 처리한 경우 과세자문관리를 위한 ‘진행사건관리’, ‘자문사후관리’ 등을 국세청 대내포털시스템에 입력하여 전산관리하여야 한다.	제24조(자문내역의 전산관리) 국세청장(심사2담당관), ---------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
제25조(재검토기한) 이 훈령은 ｢훈령ㆍ예규 등의 발령 및 관리에 관한 규정｣(대통령훈령 제394호)에 따라 이 훈령을 발령한 후의 법령이나 현실 여건의 변화 등을 검토하여야 하는 2023년 12월 23일까지 효력을 가진다.	제25조(재검토기한) 이 훈령은 ｢훈령ㆍ예규 등의 발령 및 관리에 관한 규정｣에 따라 2023년 7월 10일 기준으로 매 3년이 되는 시점(2026년 7월 9일까지를 말한다)마다 타당성을 검토하여 개선 등의 조치를 하여야 한다.
부칙(2021. 2. 21. 국세청 훈령 제2418호) 제1조(시행일) 이 규정은 2021년 2월 1일부터 시행한다.	부칙(2023. 7. 10. 국세청 훈령 제0000호) 제1조(시행일) 이 규정은 2023년 7월 10일부터 시행한다.