사무처리규정 신·구조문대비표

현 행	개 정 안
제1조(목적)	제1조(목적)
이 규정은 중소기업 세액공제·감면 세무컨설팅 제도 운영에 관하여 기본적․공통적으로 필요한 사항과 사무처리 절차를 규정함으로써 체계적이고 효율적인 사무집행을 도모하며, 납세자의 성실신고를 지원하는데 그 목적이 있다.	---- 법인세 공제･감면 컨설팅----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
제2조(정의)	제2조(정의)
1. “중소기업 세액공제·감면 세무컨설팅 제도”란 ｢조세특례제한법｣ 제2조제1항제8호에 따른 조세특례 중 세액공제 또는 세액감면를 적용받으려는 중소기업이 특정한 거래 또는 행위에 관하여 세액공제 또는 세액감면의 적용 가능 여부, 공제세액 또는 감면세액의 계산, 제출서류, 절차 등을 자문하는 경우 관할 지방국세청장이 서면으로 답변하는 등 납세서비스를 제공함으로써 세액공제 또는 세액감면에 대한 불확실성을 사전에 해소하여 중소기업의 성장을 지원하는 제도를 말한다.	1. “법인세 공제·감면 컨설팅 제도 ”----- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
2. “현장확인”이란 간접확인 방식의 업무처리로는 이 규정에 따른 업무수행이 부적합한 경우에 사실관계 확인을 위해 제6호에 따른 세무컨설팅 담당이 해당 납세자 또는 사업장 등에 직접 출장하여 당초 출장목적 범위에서 특정사항이나 사업실상 등을 확인하는 행위를 말한다.	2. ------------------------------------------------------------------------------------ 제5호에 따른 공제･감면 컨설팅 ----------------------------------------------------------------------------------------------.
3. “수입금액”이란 기업회계와 세무회계의 차이조정을 거친 후의 “조정 후 수입금액”으로서 ｢법인세법 시행규칙｣ 별지 제1호 서식의 ㉝ 수입금액을 말한다.	<삭 제>
4. “신고내용 확인”이란 납세자의 자발적인 성실신고를 유도할 수 있도록 신고 안내자료의 반영 여부 등 신고내용을 검토하여 특정 항목이나 유형의 오류 또는 누락 혐의가 있는 납세자를 확인 대상자로 선정하고, 서면으로 해명 및 수정신고를 안내하는 방법으로 신고내용의 적정 여부를 확인하는 업무를 말한다.	3. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
5. “감면법인 사후관리”란 「조세특례제한법」에 따라 조세를 공제 또는 감면 받은 법인에 대해 법령에 정한 사후관리요건의 이행 여부 또는 세원관리상 필요에 따라 서면 또는 현장확인 방법 등으로 관리하는 것을 말한다.	4. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
6. “세무컨설팅 담당”이란 중소기업 세액공제·감면 세무컨설팅(이하 “세무컨설팅”이라 한다) 업무에 종사하는 국세공무원을 말한다.	5. “공제･감면 컨설팅 담당”이란 법인세 공제·감면 컨설팅(이하 “공제･감면 컨설팅”이라 한다) ---------------------------.
제3조(비밀유지의 의무)	제3조(비밀유지의 의무)
① 세무컨설팅 담당은 업무처리 과정에서 알게 된 신청법인의 과세정보를 외부에 제공 또는 누설하거나 목적 외의 용도로 사용하여서는 아니 된다. 다만, ｢국세기본법｣ 제81조의13제1항 단서의 사유에 해당하는 경우에는 그 사용 목적에 맞는 범위에서 신청법인의 과세 정보를 제공할 수 있다.	① 공제･감면 컨설팅 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
② 세무컨설팅 담당 공무원은 세무컨설팅과 관련하여 알게 된 사실 중 일반적으로 공표되지 아니한 사항 또는 공표되는 경우 정부와 해당 법인에게 불이익이 되는 사항에 대하여는 재직 중은 물론 퇴직 후에도 누설해서는 아니 된다.	② 공제･감면 컨설팅 ---- 공제･감면 컨설팅 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
제2장 중소기업 세무컨설팅의 신청 및 제공	제2장 법인세 공제･감면 컨설팅 신청 및 제공
제5조(업무의 총괄 및 집행부서)	제5조(업무의 총괄 및 집행부서)
① 국세청 공익중소법인지원팀장은 세무컨설팅 업무를 총괄한다.	① ---------------------- 공제･감면 컨설팅 -------.
② 세무컨설팅을 신청한 법인의 본점 또는 주사무소(외국법인의 경우 국내사업장을 말하며, 이하 같다) 소재지 관할 지방국세청장(법인세과장)은 세무컨설팅 업무를 집행한다.	② 공제･감면 컨설팅 ------------------------------------------------------------------------------------------- 공제･감면 컨설팅 ------------.
제6조(신청요건)	제6조(신청대상)
｢조세특례제한법｣ 제2조제1항제8호에 따른 세액공제 또는 세액감면(같은 법 제10조에 따른 연구·인력개발비에 대한 세액공제는 제외한다)을 적용받고자 하는 법인으로서 다음 각 호의 요건에 모두 해당하는 법인은 세무컨설팅을 신청할 수 있다.	------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ｢조세특례제한법 시행령｣ 제2조의 규정에 의한 중소기업(유예기간 중에 있는 기업을 포함한다)에 해당하는 법인은 공제･감면 컨설팅을 신청할 수 있다.
1. 세무컨설팅 신청일이 속하는 사업연도의 직전 사업연도 수입금액(신청일이 법인세 과세표준 신고기한 전인 경우에는 전전 사업연도 수입금액을 말한다)이 1백억 원 이상이고 1천억 원 미만인 법인	<삭 제>
2. ｢조세특례제한법 시행령｣ 제2조의 규정에 의한 중소기업(유예기간 중에 있는 기업을 포함한다.	<삭 제>
제7조(대리인)	제7조(대리인)
① 신청법인이 세무컨설팅 신청을 대리인에게 위임한 경우에는 이를 신청법인이 신청한 것으로 본다.	① ----- 공제･감면 컨설팅 ---------------------------------------------------.
③ 신청법인이 세무컨설팅 신청과 관련하여 대리인을 위임 또는 해임한 때에는 그 내용을 증명할 수 있는 서류를 서면으로 제출하여야 한다.	③ ---- 공제･감면 컨설팅 -------------------------------------------------------------------------------------.
제8조(신청기한)	제8조(신청기한)
① 제6조 각 호의 요건을 갖춘 법인으로서 세무컨설팅을 신청하고자 하는 법인(이하 “신청법인”이라 한다)은 특정한 거래 또는 행위를 개시하거나 그 특정한 거래 또는 행위에 관한 의사결정을 한 날의 다음 달 말일까지 본점 또는 주사무소 소재지 관할 지방국세청장(법인세과장)에게 신청하여야 한다. 다만, 신청법인이 부득이한 사유가 있는 때에는 특정한 거래 또는 행위를 개시한 날이 속하는 사업연도의 종료일의 다음 달 말일까지 신청할 수 있다.	① --- 요건 ------------------ 공제･감면 컨설팅---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.
제9조(신청방법)	제9조(신청방법)
1. 중소기업 세액공제·감면 세무컨설팅 신청서(별지 제1호 서식)	1. 법인세 공제･감면 컨설팅 신청서(별지 제1호 서식)
제11조(보완요구)	제11조(보완요구)
① 지방국세청장(법인세과장)은 세무컨설팅 신청서 및 첨부서류의 내용이 미비하거나 세무컨설팅을 제공하기 위해 추가로 필요한 자료가 있는 경우에는 신청법인에게 14일 이내의 기간을 정하여 보완을 요구할 수 있다.	① ----------------------- 공제･감면 컨설팅 -----------------------공제･감면 컨설팅-------------------------------------------------------------------------------------.
② 제1항에 따른 보완 요구는 ｢중소기업 세무컨설팅 신청서류 보정요구서(별지 제2호 서식)｣로 한다.	② ----------------------- ｢법인세 공제･감면 컨설팅 -------------------------------.
제12조(신청의 취하)	제12조(신청의 취하)
신청법인은 세무컨설팅을 제공받기 전까지 그 신청을 취하할 수 있다. 이 경우 지방국세청장(법인세과장)은 제출된 신청서와 첨부서류를 신청법인에게 반환하여야 한다.	------ 공제･감면 컨설팅 -------------------------------------------------------------------------------------------------.
제13조(신청서의 반려)	제13조(신청서의 반려)
지방국세청장(법인세과장)은 세무컨설팅 신청내용이 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 신청법인에게 세무컨설팅 신청서를 반려할 수 있다. 이 경우 그 사유를 서면으로 신청법인에게 통지하여야 한다.	----------------- 공제･감면 컨설팅 ------------------------------------------------- 공제･감면 컨설팅 ---------------------------------------------------------.
제14조(현장확인)	제14조(현장확인)
① 세무컨설팅을 제공하기 전에 사실관계 확인 등이 필요한 경우에 한하여 현장확인을 실시할 수 있다.	① 공제･감면 컨설팅 ------------------------------------------------------------.
제15조(세무컨설팅의 제공)	제15조(공제･감면 컨설팅의 제공)
① 지방국세청장(법인세과장)은 신청법인에게 세무컨설팅 신청일의 다음 달 말일까지 세무컨설팅을 제공하여야 한다.	① ----------------------- ----- 공제･감면 컨설팅 ---------------- 공제･감면 컨설팅 -----------.
② 제1항에 따른 세무컨설팅 제공은 ｢중소기업 세무컨설팅 신청에 대한 답변서(별지 제4호 서식)｣에 의하여 신청법인에게 서면으로 통지하여야 한다.	② ------ 공제･감면 컨설팅 -- ｢법인세 공제･감면 컨설팅 신청에 대한 답변서(별지 제4호 서식)｣------------------------------.
③ 지방국세청장(법인세과장)은 세무컨설팅 신청내용 중 법령해석이 필요하거나 파급효과가 클 것으로 예상되는 사항, 기타 지방국세청장(법인세과장)이 단독으로 판단하기 곤란한 사항에 대하여는 법령사무처리규정에 따른 과세기준자문 또는 과세사실판단자문사무처리규정에 따른 과세사실판단자문을 신청한 후 그 회신내용에 따라 지방국세청장 명의의 ｢중소기업 세무컨설팅 신청에 대한 답변서｣를 통지하여야 한다.	③ ----------------------- 공제･감면 컨설팅 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ｢법인세 공제･감면 컨설팅 신청에 대한 답변서｣-----------.
④ 지방국세청장(법인세과장)은 세무컨설팅 신청에 대한 답변서를 통지한 후 답변내용의 오류 또는 잘못이 발견될 경우 즉시 공문으로 정정 답변하여야 한다.	④ -----------------------공제･감면 컨설팅 ---------------------------------------------------------------------------.
+제16조(세무컨설팅의 효력)	제16조(공제･감면 컨설팅의 효력)
① 신청법인이 제15조에 따른 ｢중소기업 세무컨설팅 신청에 대한 답변서｣를 신뢰하고 답변내용에 따라 특정한 거래 또는 행위를 이행하거나 ｢조세특례제한법｣에 따른 세액공제 또는 세액감면을 신청한 경우에는 답변내용에 해당하는 부분은 법인세사무처리규정에 따른 신고내용 확인 및 감면사후관리 대상에서 제외하며, 지방국세청장 또는 세무서장은 추후 해당 거래 또는 행위에 대해 경정 또는 결정 시 답변내용을 따라야 한다.	① ---------------- ｢법인세 공제･감면 컨설팅 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 부분에 대해 다음 각 호와 같은 효력을 부여한다. 1. ｢국세기본법｣ 제48조(가산세 감면 등)제1항제2호에 따라 과소신고가산세를 부과하지 아니한다. 2. 신고내용 확인 및 감면법인 사후관리 대상에서 제외한다.
② 제1항에도 불구하고 신청법인의 법인세 과세표준 신고 이후에 당초 답변내용을 정정하거나 새로운 유권해석의 발생 또는 국세청·감사원의 감사결과 처분지시로 지방국세청장 또는 세무서장이 당초 답변내용과 다르게 과세처분(수정신고를 포함한다)하는 경우로서 ｢국세기본법｣ 제48조제1항에서 규정하는 의무불이행에 대한 정당한 사유가 있는 경우에는 과소신고가산세를 부과하지 아니한다.	<삭 제>
제17조(제도에 대한 홍보)	제17조(제도에 대한 홍보)
① 지방국세청장(법인세과장)은 제6조에 해당하는 법인을 대상으로 각 지방국세청의 인력을 감안하여 매년 세무컨설팅을 위한 제도홍보 계획을 수립하여 홍보를 실시한다.	① --------------------------------------------------------------------------- 공제･감면 컨설팅 ---------------------------------.
제18조(유효기간)	제18조(재검토기간)
이 훈령은 ｢훈령·예규 등의 발령 및 관리에 관한 규정｣(대통령훈령 제431호)에 따라 2022년 7월 1일을 기준으로 매 3년이 되는 시점(2025년 6월 30일까지를 말한다)마다 그 타당성을 검토하여 개선 등의 조치를 하여야 한다.	------------------------------------------------------------- 2023년 3월 1일 ----------------- (매 3년째의 2월 28일 ------)-------------------------------------------------.